Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CNTFRP26992 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CNTFRP26992 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CNTFRP26992 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CNTFRP26992 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CNTFRP26992 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CNTFRP26992 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CNTFRP26992 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CNTFRP26992 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CNTFRP26992 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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CNTFRP26992 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTFRP26992 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CNTFRP26992 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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