Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms