Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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