Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BCL3P20749 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BCL3P20749 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCL3P20749 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCL3P20749 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCL3P20749 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCL3P20749 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCL3P20749 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCL3P20749 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCL3P20749 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCL3P20749 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCL3P20749 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCL3P20749 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCL3P20749 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCL3P20749 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCL3P20749 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BCL3P20749 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms