Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms