Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSP16219 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSP16219 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSP16219 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSP16219 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSP16219 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACADSP16219 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACADSP16219 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACADSP16219 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACADSP16219 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACADSP16219 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACADSP16219 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACADSP16219 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACADSP16219 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms