Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA1P15085 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA1P15085 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPA1P15085 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPA1P15085 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms