Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA4P12838 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA4P12838 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA4P12838 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA4P12838 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA4P12838 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA4P12838 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA4P12838 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DEFA4P12838 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DEFA4P12838 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms