Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms