Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEFLP07196 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEFLP07196 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFLP07196 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFLP07196 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFLP07196 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFLP07196 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFLP07196 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFLP07196 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFLP07196 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFLP07196 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFLP07196 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFLP07196 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFLP07196 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFLP07196 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFLP07196 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFLP07196 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFLP07196 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFLP07196 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEFLP07196 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEFLP07196 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEFLP07196 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEFLP07196 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEFLP07196 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFLP07196 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFLP07196 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFLP07196 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFLP07196 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFLP07196 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFLP07196 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFLP07196 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFLP07196 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFLP07196 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFLP07196 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFLP07196 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFLP07196 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFLP07196 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFLP07196 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFLP07196 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEFLP07196 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms