Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13BP05160 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
F13BP05160 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
F13BP05160 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
F13BP05160 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
F13BP05160 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
F13BP05160 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
F13BP05160 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
F13BP05160 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
F13BP05160 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
F13BP05160 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
F13BP05160 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
F13BP05160 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms