Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CFDP00746 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFDP00746 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFDP00746 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFDP00746 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFDP00746 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFDP00746 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFDP00746 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFDP00746 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFDP00746 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CFDP00746 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CFDP00746 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFDP00746 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFDP00746 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFDP00746 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFDP00746 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFDP00746 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CFDP00746 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFDP00746 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFDP00746 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms