Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
POLR1AO95602 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR1AO95602 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms