Protein–RNA interactions for Protein: O75971

SNAPC5, snRNA-activating protein complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC5O75971 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC5O75971 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms