Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TIPRLO75663 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TIPRLO75663 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms