Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GMDSO60547 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GMDSO60547 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms