Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNCRIPO60506 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYNCRIPO60506 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms