Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSPLO15194 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSPLO15194 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSPLO15194 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSPLO15194 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSPLO15194 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSPLO15194 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSPLO15194 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSPLO15194 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSPLO15194 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSPLO15194 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSPLO15194 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSPLO15194 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSPLO15194 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSPLO15194 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTDSPLO15194 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTDSPLO15194 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms