Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLGNO14967 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLGNO14967 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CLGNO14967 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLGNO14967 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLGNO14967 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLGNO14967 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLGNO14967 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLGNO14967 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLGNO14967 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLGNO14967 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLGNO14967 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLGNO14967 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLGNO14967 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLGNO14967 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms