Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASKO14936 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASKO14936 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASKO14936 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASKO14936 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms