Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms