Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms