Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF3AQ9Y496 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms