Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TPRKBQ9Y3C4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPRKBQ9Y3C4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms