Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms