Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3Q9UPQ7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms