Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FOXD3Q9UJU5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms