Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATPIF1Q9UII2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms