Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP35Q9P2H5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
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