Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms