Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPEF2Q9C093 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms