Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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