Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYCP2Q9BX26 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP2Q9BX26 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms