Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAGR1Q9BTK6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAGR1Q9BTK6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms