Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TUBA1CQ9BQE3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms