Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms