Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSNARE1Q96NA8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms