Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCZQ96LD1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCZQ96LD1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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