Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG2BQ96BY7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms