Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB7BQ96AH8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms