Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA4DQ92854 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA4DQ92854 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms