Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRUQ92729 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRUQ92729 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms