Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS1

CLDND2, Claudin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND2Q8NHS1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDND2Q8NHS1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms