Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNERQ8NFT8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNERQ8NFT8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms