Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms