Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTL3Q8N8U3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTL3Q8N8U3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms