Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GDPD3Q7L5L3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GDPD3Q7L5L3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms