Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM5Q71RC9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms