Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TREML4Q6UXN2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TREML4Q6UXN2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TREML4Q6UXN2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TREML4Q6UXN2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TREML4Q6UXN2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TREML4Q6UXN2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TREML4Q6UXN2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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