Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VSTM1Q6UX27 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms